Horatio Caine (David Caruso), es un ex detective del departamento de Nueva York, altamente especializado en explosivos. Acostumbrado a trabajar siguiendo siempre su instinto y teniendo como referente todas las pruebas forenses que recoge caso a caso, es el jefe del equipo de "CSI Miami".

Este equipo está formado por Calleigh Duquesne (Emily Procter), una atractiva detective especializada en balística; Eric Delko (Adam Rodriguez), especialista en inmersiones y en misiones submarinas, experto conocedor del mundo subacuático de Florida y el experto policía Ryan Wolfe (Jonathan Togo).

Además, el equipo cuenta con la inestimable ayuda del sargento Frank Tripp (Rex Linn), un policía de la vieja guardia; y de Natalia Boa Vista (Eva La Rue), cuya entrada en el equipo al principio no es muy bien vista. Por último, el integrante más reciente del equipo, Walter Simmons (Omar Miller), un fotógrafo especializado en escenas de crimen que ayuda a Horatio a resolver los puzzles criminales con sus capacidades analíticas.

En el primer episodio de esta novena temporada, el equipo de "CSI Miami" pierde a uno de sus componentes, al ser asesinado a manos de un escurridizo e ingenioso criminal.